Přístroje pro :
Přístroje pro molekulární genetiku
NextSeq
- Výrobce: Ilumina
- V CLIPu od roku 2015
- Jedná se o sekvenační nástroj nové generace pracující na principu masivně-paralelního sekvenování umožňuje sekvenování exomů, transkriptomů i cílených genomových úseků
- Pracuje na principu fluorescenčně značených nukleotidů pro detekci jednotlivých bází začleňovaných do rostoucích řetězců DNA
- Umožňuje získání až 400M readů v jediném běhu s volitelnou délkou 75-150bp
Ion Personal Genome Machine® (PGM™) Sequencer
- Výrobce: Life Technologies
- V CLIPu je od roku 2012
- Jedná se o stolní sekvenátor nové generace pracující na principu masivně-paralelního sekvenování. Během sekvenace přístroj detekuje vodíkové ionty, které se uvolňují po zapojení nukleotidu do DNA řetězce a získanou informaci převádí do digitální podoby.
- Dokáže pracovat se 3 typy polovodičových čipů, při použití největšího z nich je možné během několika hodin získat az 1 Gb sekvenačních dat.
- Produkuje ready o délce 35 - 400 bp s přesností 99 %
- Plánujeme jej využít při sledování minimální reziduální nemoci pomocí stanovení repertoáru přestaveb genů pro imunoglobuliny a T-buněčné receptory
 |
 |
 |
Agilent 2100 Bioanalyzer
- V CLIPu je od roku 2005 a od roku 2009 jsou 2
- Používáme jej k vyhledávání vhodných cílů pro sledování minimální reziduální nemoci u pacientů s akutní lymfoblastickou leukemií
LightCycler480 II
- Výrobce: Roche
- V CLIPu je jiz nekolik let
- Používá se pro vyhledávání bodových mutací, které zvyšují pravděpodobnost výskytu trombofilních onemocnění
TaqMan 7500 Fast Real Time PCR System
- Výrobce: Applied Biosystems
- V CLIPu máme 3, první od roku 2008 a poslední přibyl letos
- Používají se na sledování minimální reziduální nemoci u akutních lymfoblastických i myeloidních leukémií
iCycler iQ Multicolor Real-Time PCR Detection System
- Výrobce: Bio-Rad
- V CLIPu máme 3
- Používají se na sledování minimální reziduální nemoci u akutních lymfoblastických i myeloidních leukémií
Cytometrické přístroje
Hmotnostní cytometr CyTOF 2
- Výrobce: DVS Sciences/Fluidigm
- V CLIPu je od roku 2015
- Umožňuje detekci až 120 molekulárních značek neradioaktivních izotopů na buňce: http://youtu.be/TCxk_30cTL4
 |
 |
 |
Průtokový cytometr Cyan ADP
- Výrobce: Dako, Glostrup, Dánsko
- V CLIPu je od roku 2006
- Je vybaven třemi lasery:
fialovým (405 nm, 100 mW)
červeným (642 nm, 60 mW)
na zakázku je rozšířen o modrý koherentní (488 nm, 20 mW) OBIS, Coherent, Santa Clara, CA, USA - Přístroj je schopen měřit až 9 fluorescenčních parametrů
- Používáme ho například k měření buněk, lymfocytárních subpopulací, leukémií, minimální reziduální nemoci atd.
BD FACS LSR II
- Výrobce: BD Bioscience, San Jose, CA, USA
- V CLIPu je od roku 2006
- Přístroj BD LSR II je po úpravách vybaven čtyřmi lasery:
standardním modrým (488 nm, 20 mW)
diodovým červeným (637 nm, 140 mW) OBIS, Coherent, Santa Clara, CA, USA
diodovým fialovým (405 nm, 120 mW) Omicron-Laserage Laserprodukte GmbH, Rodgau, Německo
navíc je doplněn o koherentní OPLS žluto-zelený (561 nm, 75 mW) Coherent, Santa Clara, CA, USA - Toto osazení nám dovoluje měřit až 17 fluorescenčních parametrů
- LSR II používáme například k měření DNA, mozkomíšních moků, PNH, EMA a k vetšině výzkumných měření
 |
 |
 |
BD FACS Canto II
- Výrobce: BD Bioscience, San Jose, CA, USA
- V CLIPu je od roku 2011
- Přístroj BD FACS Canto II je vybaven třemi standardními lasery:
modrým (488 nm, 20 mW)
červeným (637 nm, 17 mW)
fialovým (405 nm, 30 mW) - Přístroj je schopen měřit 8 fluorescenčních parametrů
- Zkumavky lze měřit ručně nebo automaticky pomocí karuselu
- Canto II používáme například k měření Euroflow studie, ALOTu, lze měřit i DNA, EMA, PNH a jiné
 |
 |
 |
BD FACS Aria III
- Výrobce: BD Bioscience, San Jose, CA, USA
- V CLIPu je od roku 2011
- Přístroj BD FACS Aria III je vybaven třemi lasery:
standardním modrým (405 nm, 50 mW)
standardním fialovým (405 nm, 50 mW)
a diodovým červeným (637 nm, 40 mW) OBIS, Coherent, Santa Clara, CA, USA - Díky této konfiguraci je přístroj schopen měřit 11 fluorescenčních parametrů
- FACS Arii III používáme hlavně k sortování lymfocytárních subpopulací
 |
 |
 |
Cell Lab QUANTA SC MPL
- Výrobce: Beckman Coulter, Brea, CA, USA
- Přístroj Cell Lab QUANTA je vybaven jedním modrým (488 nm, 50 mW) laserem a rtuťovou výbojkou (365 nm, 100 W)
- Přístroj schopen měřit 3 fluorescenční parametry
- Cell Lab QUANTA je vybaven podavačem pro běžné 6ml zkumavky, mikro centrifugační zkumavky nebo 24-, 96- a 384-jamkové destičky.
- Přístroj je také schopen stanovovat koncentraci buněk bez nutnosti použití kalibračních kuliček
 |
 |
 |
Spektrální cytometr SONY SP6800
- Výrobce: SONY Biotechnology, Inc.
- V CLIPu je od roku 2015
-
Přístroj SONY SP6800 je vybaven 3 lasery:
- modrým (488nm)
- červeným (638nm)
- fialovým (405nm)
- Umožňuje detekci a dekonvoluci spekter fluorescenčních značek, maximální počet současně měřených fluorescenčních parametrů je dán dostupností fluorochromů s odlišnými spektrálními charakteristikami
 |
 |
 |
Separační přístroje
RoboSepTM
- Výrobce: Stemcell Technologies
- V CLIPu je od roku 2009
- Jedná se o plně automatizovaný separátor buněk pracující na principu imunomagnetické separace
- Používáme jej k obohacování vzorku buněk o cílové subpopulace, např. k depleci nemaligních lymfocytů ze vzorku akutní myeloidní leukemie
 |
 |
ÄKTAFPLC
- Výrobce: GE Healthcare Life Sciences
- V CLIPu je od roku 2009
- Jedná se o chromatografický systém pro rychlou a snadnou purifikaci proteinů, vybavený automatickým nasáváním a sběračem vzorků
- Používáme jej spolu s chromatografickou kolonu Superdex 200 10/300 GL k separaci proteinů na jednotlivé hmotnostní frakce v rozsahu 700 až 10 kDa
 |
 |
 |
